1- سهولة التنصت على مكالماته
لا يمتلك هذا البرنامج أي ميزة تشفير وبالتالي كانت كل مراسلاتك وجهات اتصالك عرضة للتجسس من قبل كل من يستطيع مراقبة اتصالك بالإنترنت. اسم المستخدم في الواتس آب هو عبارة عن رقم الهاتف، أما كلمة المرور فيتم إنشاؤها تلقائيا عند تسجيل الاشتراك بالبرنامج، ويتم إرسال اسم المستخدم في كل مرة تستعمل البرنامج بصيغة نص غير مشفر، ما يعني أن كل من يستطيع مراقبة اتصالك سيتمكن من معرفته.
2- فشل إتمام المكالمات
واجهت الميزة الجديدة للمكالمات العديد من شكاوي المستخدمين، عقب فشل الاتصال الصوتي حين يظهر للمستخدم أن عملية الاتصال جارية ويبدو له أن هاتف المتصل به يستقبل المكالمة، في الوقت الذي لا يظهر تطبيق الواتس آب على الطرف الآخر أية إشارة بورود مكاملة، وإنما يعلم في وقت لاحق عبر شريط الحالة العلوي، أن لديه مكالمات لم يرد عليها.
3- إتاحته للأندرويد فقط
لا يمكن تنزيل التطبيق إلا على هواتف الأندرويد فالشركة أرادت مغازلة القطاع الأكبر من مستخدمي الهواتف الذكية حيث يتجاوز عددهم مليار مستخدم حول العالم ووصل عدد مستخدمي الواتس آب إلى 700 مليون حول العالم.